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LIMS系統的嚴謹性、可控性在權限控制方面已得到很好的體現。不同職位擁有相應的不同權限是一項基本控制，也是流程規范的體現。在LIMS系統當中，權限支持可配置，支持自由組合，其靈活度得到用戶好評。
訪問權限管理是計算機化系統管理的一項基本管理要求，其必要性，就如同出入廠區的門禁設置，人員出入需要通行證，門禁會將沒有相關權限的人員擋在外邊，允許有權限的人員進入，從而起到保護和限制的作用。
LIMS系統權限管理必要性舉例如下：
從實驗室的要求看權限管理有三個基本要素：
1. 恰當的職責（與崗位職責匹配）；
2. 具有資質（具有操作資格）；
3. 合適的權限（跟職責匹配的訪問權限水平）。
圍繞以上三個要素，企業需要做很多基礎性工作，以保證這三個要素的實現。
LIMS系統操作涉及“組織機構”和“人員”以及“崗位”。
在LIMS系統中，清晰準確的操作權限設定至關重要。如果沒有賦予使用者某些權限，相應的操作將無法執行。LIMS的權限管理主要是通過系統中設置各流程模塊的訪問權限和操作權限，實現實驗室各組織部門和崗位人員的職能分配，即根據實驗室真實環境中人員和組織機構（部門和崗位）之間的關系分配。組織機構是實驗室中的各個部門和崗位，人員是實驗室內行使職責的員工。
LIMS系統操作中的權限和角色概念：
LIMS中涉及到權限、角色兩個概念：權限就是對系統中某些菜單的訪問和操作；角色是承載權限的一個集合體，相當于一個容器，里面裝著對各種數據操作的動作。不同角色的人員，擁有不同的權限，享有不同的數據，處理不同的事務，從而保證了數據與操作的安全性。
LIMS中角色和權限的分配和設置規則一般如下圖所示：

上圖中的各序號之間均是多對多的關系：
（1）表示相應的權限可以賦予多個角色，一個角色可以擁有多個權限；
（2）表示系統的模塊權限可以賦予多個員工，同時一個員工可以擁有多個模塊的操作權限；
（3）表示一個模塊的權限可以賦予多個部門或崗位，同時一個部門或崗位擁有多個模塊的操作權限；
（4）表示一個角色可以賦予多個員工，同時一個員工也可以擁有多個角色；
（5）表示一個部門可以有多個員工，個別特殊員工可以屬于多個部門；
（6）表示一個角色可以賦予多個部門，一個部門也可以擁有多個角色。
LIMS系統操作權限的分配和設置規則是按照實驗室內部員工崗位、部門職能進行設定的。通過對實施過程的記錄，總結基本情形及處理方式如下：
對于角色來說，可以通過上述方式（1）將需要進行批量賦予的權限先封裝到一個容器角色里。
從員工的角度看，可以通過方式（4）將不同的角色賦予給一個人，同時也可以通過方式（2）將某些模塊的獨立權限賦予某一個人，LIMS系統支持將權限或角色單獨賦予某一個人。
對于各個部門或崗位而言，可以用上述方式（3）直接將某些模塊或數據的權限賦予相關部門或崗位，如樣品請驗，可以通過部門將請驗的數據進行篩選；
也可以用間接方式（6）將某一個權限的集合體即某個角色賦予各個部門，這些角色集合了對某一類數據的操作，或者用間接方式（5）將已經被賦予了權限的員工分到某些部門，如果員工從一個部門調到另一個部門，此人員將被賦予新部門的權限。
通過了解LIMS系統權限與角色的基礎概念，總結權限分配與設置多樣方法，可以靈活設置LIMS權限，最終達到對實驗室進行合規管理目的，提升實驗室的管理水平和工作效率。如圖：

可清晰直觀的對模塊進行權限分配，每個崗位都可以根據職責，賦予對應的模塊權限。權限又分為兩種，查閱權限與操作權限。
LIMS系統在明確操作權限管理規則后，其將為實驗室有序開展工作奠定堅實基礎，降低各行業實驗室管理風險，提升實驗室管理整體效率，實現實驗室信息化優質發展，助力各行業高質量加速發展。